宋元时期

宋元时期，吴姓已遍布全国。上代的一些吴姓大宗仍保持兴盛局面，季扎次子吴征生一支在两宋产生了科举官宦世家吴相家族，濮阳吴氏的一支经辗转迁徙后形成根深叶茂的汝南--太原吴氏，渤海吴氏成员南迁江南后落地生根，在两宋时期形成江南第一望族吴宣家族。沉寂上千年之久的吴姓正宗季扎四子吴子玉一支延陵吴氏开始复兴。隐姓达千余年的季扎长房后裔洞庭濮氏于南宋初年复姓归宗。这一时期，由于民族关系问题的存在，宋金长期对峙，产生了影响深远的吴氏军事世家甘肃水洛吴玠、吴磷家族。以上吴姓望族都很重视世系传承，其历史渊源十分清晰。

明清时期

明清时期，吴姓的分布更为广泛，自上古保持世系传承不乱，代有显贵的世家大族几乎绝迹。这时期吴姓望族大都由唐宋时期的单家发展而来，并从地区分布上呈同姓异宗交叉分布，吴姓的迁徙多是由于战乱、灾荒、析居、任官、政府组织移民等诸多原因引起的。例如，明清时期的江西南昌吴氏虽号称诸樊、夫差后裔，但其先祖却是来自安徽歙县的流民，定居南昌后，繁衍成当地大族。江西德兴建节的吴氏则是唐末为避黄巢兵乱而迁来的。江西戈阳吴氏在五代战乱时，从金陵(今南京)迁来的。湖南益吴氏主要有三支，九都冲吴氏其先祖吴世春、吴永鉴叔侄二人自江西清江来湖南益阳经商，从而定居益阳，后裔繁衍成益阳九都冲吴氏。泉峰吴氏，其先祖在元初游学湖南，而定居益阳，后世繁衍成益阳泉峰吴氏。夹流溪吴氏则是明初从江苏、江阴县迁居湖南益阳夹流溪，据其家谱记载，到清乾隆时，这支吴氏已传了13代。

近现代吴氏

在近现代中国历史舞台上最显赫的吴姓人物当属吴佩孚。吴佩孚属登州吴氏。据说吴佩孚曾考证他是延陵吴季扎的裔孙，吴姓开氏始祖吴太伯的第12l代嫡孙。

据《吴氏家谱》记载，登州吴氏来源于泰州吴氏，而泰州吴氏又源于浙江吴田吴氏。吴田吴氏是明代浙江山阴吴氏吴溶、吴渊、吴溥的后裔。据《山阴州山吴氏族谱》记载，这支吴氏的家谱因上世家中失火被烧掉，因而吴田吴氏可确认的始祖为吴回。在历史上，吴田吴氏迁居泰州(今江苏泰州有两支，一支是吴田吴氏第十四世裔孙吴潮先迁泰州而成泰州吴氏始祖，另一支是吴田吴氏五世裔孙吴承护下传12代裔孙吴万四，也自吴田迁至泰州东的安丰。随着泰州吴氏人丁的增多，又有吴潮裔孙吴僧儿吴佩孚十七世祖自泰州北迁山东蓬莱(古属登州)，其后裔形成登州吴氏。登州吴氏虽然家族不甚显贵，但人丁倒还兴旺。登州吴氏自吴僧儿下传十六世孙吴可诚时，这支吴氏已没落无闻。

迁居台湾

吴姓的发源地江苏南部距离台湾较近，因此吴姓人迁居台湾的历史较早。早在吴国灭亡之时，吴姓子孙有一部分逃亡海上，其中一些人有可能迁到了台湾，然而见于历史记载的却是在元代。

明清以来自福建、广东沿海一带的吴氏迁居台湾的逐渐增多。在台湾的历次统计中，吴姓长期稳坐第七把交椅，这与南明永历年间郑成功渡海收复台湾，从潮州沿海，尤其是饶平、南澳、澄海各县收了不少昊姓士兵有关。在台湾历史人物中，吴姓人占有相当比重，如被称为"阿里山之神"的吴凤，宜兰的开拓者吴沙，抗倭名将吴彭年和吴汤兴，抗日民族英雄吴海水，著名作家吴浊流等都是近现代史上来台的著名吴氏子孙。