柯氏得姓源于姬姓，系春秋时吴公子柯卢之后（据《广韵》）。后裔以名为姓，尊柯卢为柯姓始祖。
据记载济阳柯蔡同宗。柯卢为太王之十世孙，蔡仲（蔡姓始祖）则为太王之玄孙，论次序蔡仲辈分较高，柯卢辈分较低，彼此关系为叔祖与侄孙，论宗支，柯卢属于太王二房虞仲派下，蔡仲则是太王三房王季派下，系柯兄蔡弟（据《济阳渊源考略》）。
唐朝僖宗光启二年（８８６），柯亮（即商庵）随王审知兄弟由河南光州固始县入闽，居泉南元妙观西水沟巷（又名担水巷，后称柯厝巷），亮为福建柯姓一世祖。
北宋仁宗天圣二年（１０２４）亮七世孙庆文登甲子科宋郊榜进士，官屯田员外郎，卒后葬永春平和里卓口山，穴名凤穴。《八闽通志》记载晋江人）。庆文生四子，长子仲翔（常）、次子仲德、三子仲吉、四子仲某（满）皆中进士，世称“父子五进士”。
仲翔名述，宋仁宗嘉祐四年（１０５９）己亥科进士，官中散大夫，龙图阁大学士。宋神宗熙宁年间（１０６８），奉旨漳州赈饥，廉洁奉公，救民无数，有双鹊栖其厅，出入伴行，事逮秩满内升，老稚攀舆，鹊也送数里不忍去。苏东坡曾咏诗赞颂，宋神宗亦赞誉曰：真瑞鹊堂也，此为柯姓之灯号“瑞鹊堂”之由。述生三子，长子元曾居漳州、龙岩各邑。次子元宝徙居莆田（即蒲阳）。三子赐仕，为福州通运使，定居省城。仲述葬永春平和里柯坂山，穴名“黄龙奔江”。
仲德名逑，登仁宗嘉祐二年（１０５７）丁酉科世程榜进士。仲吉名迪，与兄述“兄弟同榜”进士，官赣令、襄邑令。仲某（满）名廷（亦作佛岭），一甲进士。据说为廷官国子监助教，才智过人，性好游，与苏东坡、佛印禅师过从甚密，时称“东京四才子”。后来，廷到相国寺找佛印出游，佛印谈及皇后进香，他即假扮香火僧偷睹皇后芳颜，时邂逅仁宗，钦赐圆顶，赐号“佛岭禅师”。廷由此犯下欺君大罪，父兄罪其大不肖，为活命计，借佛印度牒，诈死外逃，逃入岭下叶家，与叶家女成婚，蕃衍成望族，其后代即以“佛岭”为堂号。这就是柯叶联宗之源。
元曾（述长子）官迪功郎。元曾生子国材，徙居晋江。国材名翰，宋理学名儒。南宋高宗绍兴二十四年（１１５５），举明经。明秦桧当权，遂隐居庄江教授，朱熹为同安主簿时，聘为直讲，筑高士轩以居之。翰生于宋徽宗政和六年，卒于宋孝宗淳熙三年，享年６１岁，入祀“安海乡贤”祠。
翰生三子，长缵宗，居安平，衍安海派。次子绍宗，居庄江等地。三子继宗分居各邑。缵宗名鼎承，生三子：长启学、次肇学、三勉学。启学仅生女毂英，招赘蔡十郎，居泉州南门外。 肇学号东叟，析居虺河之柯坑。
勉学号西叟，首居晋江鳌岱塘边村，他的长子铭开发南塘，为南塘祖。次子锦仍居塘边，为塘边二世，传至五世孙，有兄弟三人，长开塘市派，次开上郭派，三居柯仓，后由柯仓又分鳌岱。
柯氏昭穆：懋昭懿则，仪表千世，孝子贤孙，遵法秉礼，绍闻维德，家声克济。
南塘衍派宗亲分布于：罗山的塘市、上郭、林口、缺塘；磁灶的官前、下坂、湖头；安海；英林的下柯坑、柯村、沪厝垵、下伍堡、加排、埭边；内坑的东村、丘厝；东石的柯村、潘山；还有青阳等。人口共１２０００多人。
历代柯氏人才辈出，有“龙图学士”、“理学名儒”、“父子五进士”、“四世凤毛”、“父子伯侄科第”等。
由于历史的原因，特别是清末以来，因遭严重瘟疫、旱灾、盗匪、兵祸，宗亲大量外逃，多数徙居南洋群岛的马来西亚、新加坡、印尼、缅甸、泰国、越南及台湾、香港、澳门等国家与地区，所以现在海外还有难以计数的柯氏宗亲。