单一渊源：源于官位，出自周朝时期官吏巫马，属于以官职称谓为氏。

在周朝的官职体制中，有一种专门掌管养马并为马治病的官员，称为巫马，也就是马医官，隶属于夏官府司管辖。

在典籍《周礼·夏官》中记载：“巫马掌养疾马而乘之治，相医而药，攻马疾。”乘，就是将病马驱赶使之奔跑起来，根据病马的奔步情形判断其病因，然后再对症施治。

这在史籍《姓氏考略》中也有记载：“巫马掌养疾马而乘治之，以官为氏”。

在巫马官的后裔子孙中，有以先祖官职称谓为姓氏者，称巫马氏，后又有省文简改为单姓巫氏、马氏者，巫马氏复姓族人越来越少了，不过，皆世代相传至今。